近10万人数据分析:“苏大强病”危险基因位点新发现

2024-10-16 03:30:40 | 作者: 匿名

与早发性阿尔茨海默病(症状在30 岁时出现)相比,晚发性阿尔茨海默病(LOAD) 是最常见的失忆症形式,通常影响65 岁以上的人(Lambert 等,2013)。研究人员利用全基因组关联研究(GWAS) 确定了诊断的AD 患者基因组中与疾病相关的风险基因位点。

今天,我们发现了19 个与LOAD 相关的风险位点(Lambert 等,2013)。然而,这些信号和一些未达到阈值的相关位点只能解释31% 的LOAD 遗传风险(Gatz et al. 2013)。 al. 2006),留下大量未识别的风险位点。

最新的LOAD基因荟萃分析研究总结了近10万人(非西班牙裔白人)的遗传数据,试图找出更多相关基因位点。这项研究包括35,274 名LOAD 患者和59,163 名患者。健康受试者(研究设计详细信息见图1)。

图1:实验设计

该项目不仅证实了之前类似研究发现的风险基因位点,还发现了5个新信号(图2),分别与IQCK、ADAMTS1、ACE、ADAM10和WWOX基因相关。

图2:曼哈顿图,蓝色表示先前发现的风险基因,红色表示新发现。

这五个基因都是蛋白质编码基因。 ACE和ADAM10在之前的几项研究中被确定为AD相关候选基因,但在后续研究中并未被确定(Kim et al. 2009; Vassar, 2013)。

研究表明,WWOX 基因可能通过其与tau 蛋白的活性与AD 相关(Chang Chang,2015)。与高质量的插补小组相结合后,还发现了一些罕见疾病的风险变异。

图3列出了罕见和常见基因变异(常见变异)的通路分析(MAGMA通路分析)的结果。他们发现了四个功能簇,分别是APP代谢/A形成的调节、tau蛋白结合、脂质代谢与免疫反应相关,并且APP和A已被发现与早发性常染色体显性阿尔茨海默病有关(Rovelet-Lecrux等人,2006)。

图3:MAGMA通路分析

为了进一步探究APP/A途径的富集现象,研究人员分析了335个APP代谢基因,发现该基因组的富集存在于常见的变异体中,而ADAM10和ACE导致了这一结果。详细信息请参见图4 中的结果。

图4:APP/A相关通路分析

AD 与教育程度呈负相关,包括大学完成时间和认知分数,这支持了科学家提出的理论:更好的认知储备可以帮助抵抗LOAD 的发展(Stern,2012)。

此外,这项研究还发现,LOAD与心血管健康和糖尿病的多项指标呈负相关。这让我们想起之前的一项研究,该研究表明服用血压和糖尿病相关药物可能会降低患AD 的风险(stergaard et al. 2015)。

近10万人数据分析:“苏大强病”危险基因位点新发现

当前的大规模GWAS 研究增进了我们对复杂疾病的理解。然而,一些结果,例如本研究中罕见变异的富集通路分析,仍然表明存在未被发现的罕见基因变异,这需要我们对复杂疾病有更广泛的了解。数据量和更好的插补面板(imput panel),以及识别这些罕见的遗传变异可以帮助我们了解疾病的发病机制和药物发现。

核心文献:

Kunkle, B. W.Grenier-Boley, B.Sims, R.Bis, J. C.Damotte, V.Naj, A. C.Bellenguez, C. (2019)。对诊断出的阿尔茨海默氏病的遗传荟萃分析确定了新的风险位点,并涉及A、tau、免疫和脂质加工。自然遗传学,51(3),414。

其他参考:

1. 张,J.-Y.张,N.-S。 (2015)。 WWOX 功能障碍会诱导TRAPPC6A、TIAF1、tau 和淀粉样蛋白 顺序聚集并导致细胞凋亡。细胞死亡发现。 https://doi.org/10.1038/cddiscovery.2015.3

2.Gatz, M.Reynolds, C. A.Fratiglioni, L.Johansson, B.Mortimer, J. A.Berg, S.… Pedersen, N. L. (2006)。基因和环境在解释阿尔茨海默病中的作用。普通精神病学档案。 https://doi.org/10.1001/archpsyc.63.2.168

3.Gaugler, J.James, B.Johnson, T.Scholz, K.Weuve, J. (2016)。 2016 年阿尔茨海默病事实和数据。阿尔茨海默氏症和痴呆症。 https://doi.org/10.1016/j.jalz.2016.03.001

4.赫伯特,L.E.谢尔,P.A.比尼亚斯,J.L.贝内特,D.A.埃文斯,D.A.(2019)。美国人口阿尔茨海默病,60。

5.Kim, M.Suh, J.Romano, D.Truong, M. H.Mullin, K.Hooli, B.……Tanzi, R. E. (2009)。 ADAM10 基因中潜在的晚发性阿尔茨海默病相关突变会减弱 分泌酶活性。人类分子遗传学。 https://doi.org/10.1093/hmg/ddp323

6. Lambert, J. C.Ibrahim-Verbaas, C. A.Harold, D.Naj, A. C.Sims, R.Bellenguez, C.… Seshadri, S. (2013)。对74,046 名个体的荟萃分析确定了11 个新的阿尔茨海默病易感位点。自然遗传学。 https://doi.org/10.1038/ng.2802

7.stergaard, S.D.Mukherjee, S.Sharp, S.J.Proitsi, P.Lotta, L.A.Day, F.……Wareham, N.J. (2015)。潜在可改变的危险因素与阿尔茨海默病之间的关联: 孟德尔随机研究。公共科学图书馆医学。 https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1001841

8. Rovelet-Lecrux, A.Hannequin, D.Raux, G.Le Meur, N.Laquerrire, A.Vital, A.… Campion, D. (2006)。 APP 位点重复导致常染色体显性早发性阿尔茨海默病伴脑淀粉样血管病。自然遗传学。 https://doi.org/10.1038/ng1718

9. 斯特恩,Y. (2012)。衰老和阿尔茨海默病的认知储备。柳叶刀神经病学。 https://doi.org/10.1016/S1474-4422(12)70191-6

用户评论

蹂躏少女

哇,这个发现真是太重要了!苏大强病终于有了新的研究方向,希望这个基因位点能帮助更多患者。

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巷陌繁花丶

10万人数据分析,看来这个研究是经过严谨分析的。不过,这新发现的基因位点到底怎么应用呢?

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枫无痕

这发现太惊人了!我一直担心家里人有这个病,现在有了这个基因位点,感觉希望大了。

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千城暮雪

近10万人数据,这个研究规模太大了。希望这个新发现的基因位点能早日用于临床治疗。

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無極卍盜

苏大强病,这个病名听起来就让人害怕。这个基因位点的发现,对我们来说是个好消息。

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致命伤

数据分析到这个程度,真是让人佩服。期待这个新发现的基因位点能带来突破性治疗。

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高冷低能儿

每次看到这种研究进展,都感觉离治愈苏大强病又近了一步。希望这个基因位点能带来真正的改变。

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苍白的笑〃

10万人的数据,这个研究规模太庞大了。希望这个基因位点的发现能帮助到我认识的那些患者。

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红玫瑰。

这个基因位点的发现,对于苏大强病的研究来说是个里程碑。期待更多研究成果的公布。

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鹿先森,教魔方

对于苏大强病的患者来说,这个新发现的基因位点可能是个福音。希望医生们能尽快找到治疗方法。

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歆久

这个研究太有意义了,希望这个基因位点能成为治疗苏大强病的关键。

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西瓜贩子

虽然这个基因位点的新发现让人兴奋,但我也担心这种研究背后的伦理问题。

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熏染

看到这个基因位点的发现,我仿佛看到了苏大强病患者的希望。希望他们能早日得到有效的治疗。

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服从

这个基因位点的发现,对于我们这些关心苏大强病的人来说是个巨大的鼓舞。谢谢研究人员们的努力!

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命里缺他

苏大强病,这个病名让人印象深刻。这个基因位点的发现,希望能为患者带来新的治疗希望。

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我怕疼别碰我伤口

这个研究太有意义了,希望能有更多类似的发现。希望苏大强病患者能早日摆脱疾病的困扰。

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采姑娘的小蘑菇

这个基因位点的发现,让我对苏大强病的治疗充满信心。期待更多的研究进展。

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清原

10万人的数据,这个研究规模太大了。希望这个基因位点的发现能帮助到我认识的那些患者。

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花容月貌

这个基因位点的发现,对于苏大强病的研究来说是个重大突破。期待更多关于这个位点的详细信息。

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