第一阶段（2002/2003-2008年），亚冠联赛改制后，决赛将采用主客场赛制。改制后的亚冠联赛于2002/03赛季举行。这也是唯一一次多年期亚冠联赛。随后的每场比赛均在一年内完成。 2002/03赛季亚冠决赛的两队分别是来自阿联酋的艾因队和来自泰国的BEC Trosasana。其中，阿尔艾因队在半决赛中淘汰了中国大连实德队，晋级决赛。首回合比赛，阿尔艾因主场2-0战胜对手。尽管次回合1球小负，但仍以总比分2-1夺得改革后首个亚冠冠军。随后两年亚冠决赛的冠军都是沙特豪门伊蒂哈德队。 2004年，伊蒂哈德队以总比分6-3击败韩国城南一队，首次夺得亚冠联赛冠军。两队在各自的客场比赛中均取得胜利。首轮城南一湖与伊蒂哈德3-1，回到韩国。哈德竟然以5-0击败了对手。 2005年亚冠决赛，伊蒂哈德依然势不可挡，两回合总比分5-3击败上届冠军阿尔艾因，实现两连冠。

2006年，韩国全北现代最终结束了西亚球队对亚冠联赛的垄断。半决赛淘汰对手蔚山现代队后，决赛主场2-0、客场1-2击败叙利亚阿尔卡拉马队，总比分3-2，首次夺得亚冠联赛冠军。未来两年，亚冠联赛仍然掌握在东亚球队手中。 2007年，日本浦和红宝石队以3-1击败伊朗队塞帕汉队夺得冠军； 2008年，同样来自日本的大阪钢巴两回合总比分5-0击败澳大利亚阿德莱德联队。

（6次决赛：东亚区获胜3次，西亚区获胜3次）

第二阶段（2009年-2012年），亚冠联赛在2009赛季再次进行改革，参赛球队增加到32支，决赛也由主客场制改为单场决出。结果。在此期间，亚冠决赛基本上都是韩国球队占据主导地位。韩国队全部参加了4次决赛，并取得了3胜1负的辉煌战绩。 2009年亚冠联赛决赛在日本东京国立竞技场的中立场地举行。改组前两夺亚冠联赛冠军的浦项制铁队迎战改组后两度夺冠的阿提哈德队。比赛结果是浦项制铁2-1击败对手，成为亚冠联赛三冠王（含改制前）次数最多的球队。 2010年，卫冕冠军浦项制铁队在四分之一决赛中倒下，但另一支韩国球队城南一和站了出来。他们在决赛中以3-1击败了伊朗队IS队，淘汰了浦项制铁队。法尔汉钢铁. 2011年是现阶段4年来唯一一次亚冠冠军不是韩国球队的。卡塔尔选手阿尔萨德点球大战击败全北现代夺冠，时隔22年再次登顶亚洲之巅。然而，韩国人并没有让冠军搁置太久。 2012年，蔚山现代在决赛中以3-0击败沙特阿拉伯的阿尔阿赫利，将亚冠联赛奖杯带回韩国。

（4次决赛：东亚区获胜3次，西亚区获胜1次）

第三阶段（2013年至今） 2013年，亚冠决赛以一场决胜负，回归主客场赛制。决赛两队分别是中超广州恒大和韩国K联赛首尔FC。这是继1997-1998年亚洲俱乐部冠军杯决赛大连万达之后，中国俱乐部第二次杀入亚冠决赛。决赛首回合在韩国首尔举行。凭借埃尔克森和郜林的进球，广州恒大2-2战平首尔FC。第二轮，广州恒大带着2个客场进球回到天河体育场。埃尔克森下半场率先进球。当时还在首尔踢球的德扬随后将比分扳平。 1-1的比分一直保持到终场。广州恒大以客场进球数多的优势夺得亚冠冠军。这也是继1990年辽宁队夺得亚洲俱乐部杯冠军后，又一支夺得亚洲冠军的中国俱乐部。

2013年11月25日，亚足联竞赛委员会会议决定，2014-2016年亚冠联赛严格分为东亚赛区和西亚赛区。东亚和西亚的队伍只能在决赛中相遇。 2014年亚冠联赛决赛成为该决定生效后的首场决赛。两队分别是来自澳大利亚的西悉尼流浪者队和来自沙特阿拉伯的阿尔希拉尔队。西悉尼流浪者队是本届赛事的黑马。他们先后淘汰上届亚冠亚冠亚军广州恒大和首尔FC杀入决赛。决赛首轮，西悉尼流浪者队凭借尤里奇的进球，主场1-0击败对手；第二轮沙特，西悉尼摆出钢桶阵型，最终将比分定为0-0，总比分1-0获胜。阿尔阿赫利夺得桂冠。

（2次决赛：东亚区2次获胜）

恒大的最终对手，2015年亚冠联赛半决赛第二轮，阿联酋球队阿尔阿赫利主场3-2击败沙特球队阿尔希拉尔。 23岁的韩国球员权敬元在伤停补时阶段打入绝杀球。两局总比分4-3。 2013-14赛季阿联酋海湾联赛冠军得主阿尔阿赫利晋级亚冠决赛。阿尔阿利队的哈利勒、利马和里贝罗在2015年亚冠联赛中总共打进14球。

阿赫利队的哈利勒在2015年亚冠联赛中打进6球。这位24 岁的阿联酋前锋的整个职业生涯都是在阿赫利度过的。在阿联酋国家队，哈利勒也是主力前锋，在2015年亚洲杯上打进4球，并在2018年世界杯预赛中出场4次打进5球，其中包括在阿联酋主场10-0战胜马来西亚的比赛。利勒打进4球。